南通博物苑是光绪年间状元张謇（jiǎn）以个人收藏开办的中国第一家公共博物馆,距今已经有110年历史了。因为张謇（jiǎn）是晚清实业家和教育家，创办通州师范学校、南通博物苑、女红传习所等。把实业、教育称为“富强之大本”。因为一开始曾建议学部创建国立博物馆，但遭到议论反对而被搁置。他担心学校教育不能够没有实物的验证，所以参考欧洲博物馆制度，开创了中国第一家博物馆，张謇（jiǎn）也被称为中国博物馆事业的开拓者，提出了园馆一体的理念。
南通博物苑创办于1905年，博物苑藏品分天产、历史、美术、教育四部，主要陈列于南馆、北馆等展馆内，而大型文物标本则展示于室外。苑中广植花草树木、养殖珍禽异兽，与室内展品呼应。另有各种园林设施点缀其间。由此营造成一种高雅精致而又轻松闲适的氛围。这种馆园结合的独特风貌体现了创始者建设中国特色博物馆的办馆理念。
南馆：建于1906年。初名“动矿物陈列室楼”，后称“博物馆”，是博物苑主要的陈列室，当年陈列天产、历史、美术、教育四部。楼上陈列历史文物，楼下陈列动、植、矿物标本。在二楼半圆型的月台上，悬挂着张謇手书的一副著名的对联：“设为庠序学校以教，多识鸟兽草木之名。”道出了张謇创办博物苑的宗旨，就是辅助学校教育、普及科学文化知识。南馆朝北大门两旁各有一座亭子，陈列古玄妙观的三清塑像。
北馆：建于1911年。北馆当初本是作为金石书画陈列，张謇为北馆作铭辞为：“将究四类，其广海会。金概所藏，州厅县界。力所弗堪，举例犹派。事固无小，道奚病隘。”北馆建设中，为了陈列当时从吕四海滨出土的长达十多米的鲸骨架，张謇将其改建，楼下陈列除鲸骨架外，还陈列了苑中所藏许多其它动物的骨骼标本和化石，楼上用特制的格屏，陈列通、如、泰、海名家书画，东西两间可以展阅一幅清代南通画家钱恕所作长达10米以上的山水长卷。
中馆：建于1906年。始称测候所，用以测报天气，是中国最早的气象观测机构所在地。1914年，测候所迁至农校，中馆改建后，作为金石碑帖陈列室。张謇先生亲笔题写了中馆匾额。
南通博物苑苑徽含义
南通博物苑苑徽运用中国园林中的借景手法，以最具近代博物馆象征意义的核心展馆——南馆为视角，透过南馆阳台挂落剪影眺望中馆，并与其下方的新馆馆顶开放式剪影互为呼应。外框似家具牙板，又似壶器提梁，洋溢着文化气息，充满向上感。中馆与南馆在同一中轴线组合。新馆的轮廓形又与博物馆英文“MUSEUM”开头字母“M”吻合，历史与现在、未来融为一体，张謇先生的“园馆一体”建设理念一脉相承；天圆地方的印章纹样稳重大方，百年博物苑又如一方中国印烙在世人心中。标志“园馆一体”特征鲜明，传达了我国第一个公共博物馆“时间之早”、“建设理论之新”、“实践意义之强”。
博物苑历史
1905年，张謇将建设中的通州师范学校公共植物园规建为“博物苑”，创建了我国第一个公共博物馆，隶属通州师范学校管理。张謇自为苑总理，孙钺为苑主任。
1912年，通州改建置为南通县，博物苑脱离通师而独立，称“南通县博物苑”。
1927年，博物苑附属于南通学院。 1935年7月博物苑回归通师代管。
1938年，3月17日，日本侵略军侵占南通，南通博物苑遭到破坏和掠夺，苑址被日军占用为马厩，文物除一部分在南通沦陷前夕转移外，大部分散失。
1949年，2月2日，南通解放，南通市人民政府着手恢复南通博物苑，于1950年成立南通博物苑修建委员会，并开始修建工作。
1951年，修建后的博物苑改称为“南通博物馆”，由钱啸秋副市长兼任南通博物馆馆长。同时将原博物苑园林部分另划为人民公园。
1952年，8月，改称“苏北南通博物馆”，直属苏北人民行政公署文教处。
1953年，苏南苏北合并，改称“江苏省南通博物馆”，直属江苏省人民政府文化事业管理局。同年7月，江苏省文化事业管理局决定将南通博物馆委托南通市人民政府文教科代管。
1954年，4月，江苏省人民政府决定撤销江苏省南通博物馆，馆藏文物、家具大部分移交江苏省博物馆筹备处。
1956年， 5月21日，文化部副部长郑振铎在全国博物馆工作会议中提出：“中国博物馆事业的历史并不太久，最早的公共博物馆，除了帝国主义者们在沿海地区所办的几个之外，要算是张謇他们办的南通博物苑了。” 6月9日，江苏省人民政府决定恢复南通博物馆。
1957年，4月，江苏省人民委员会决定重建南通博物馆，作为南通市文化事业机构之一，由南通市领导。8月，南通博物馆筹备处成立。9月，开始维修馆舍。
1958年，10月1日，南通博物馆正式恢复，由尤勉斋任馆长。
1968年，9月，南通博物馆与南通市图书馆、文化馆、市劳动人民文化宫、唐闸工人俱乐部合并为南通市劳动人民文化馆，成立革命委员会。
1972年，12月，南通市革命委员会决定将图书馆、博物馆从劳动人民文化馆划出，成立南通市图书、博物馆革命委员会。
1973年，4月，建立中共南通市图书、博物馆支部。
1976年，10月，南通市革命委员会决定撤销图书、博物馆革命委员会，分别成立南通博物馆革命委员会和南通市图书馆革命委员会。
1977年，1月，启用“南通博物馆革命委员会”印章。
1978年，12月，市委组织部任命：穆烜同志任南通博物馆党支部书记，徐冬昌同志任南通博物馆馆长。
1979年，1月，恢复“南通博物馆”名称，同时启用新印章。
1984年，4月，江苏省文化厅同意恢复南通博物苑原名及原貌。7月，正式恢复“南通博物苑”名称。
1999年，12月28日，南通市人民政府决定：人民公园成建制并入博物苑，结束了原博物苑长期分为两个单位的状况，恢复到创苑初的包括园林部分的南通博物苑。
2000年，11月，国家文物局批复《南通博物苑保护利用规划》。
2001年，2月，南通市文化局副局长周德芝兼任南通博物苑苑长。
2002年，8月14日，南通博物苑委托吴良镛院士为我苑设计新展馆。
2003年，3月，南通博物苑总体规划和新馆建设论证会在北京举行。5月，南通市市文化局副局长王栋云兼任南通博物苑苑长。7月，国家文物局批复《南通博物苑规划设计+单体方案》。
2004年，3月15日，中华人民共和国文化部和国家文物局同意共同举办：南通博物苑一百年暨中国博物馆事业发展百年庆典活动。
2005年，9月24日至26日，南通博物苑百年暨中国博物馆事业发展百年纪念大会庆典在江苏南通隆重召开，该活动由中华人民共和国文化部、江苏省人民政府、国家文物局主办，江苏省文化厅、南通市人民政府、江苏省文物局、中国博物馆协会、中国自然科学博物馆协会协办。中共中央政治局常委李长春、全国政协副主席刘延东发来贺电，向大会表示祝贺。全国政协副主席张克辉为“南通博物苑一百年暨中国博物馆事业发展百年纪念牌”揭牌。大会当天，隆重举行了中国博物馆事业发展百年展暨南通博物苑新馆的开馆仪式。庆典期间，在南通博物苑新馆的学术报告厅内举行了主题为“博物馆与城市发展”的中外博物馆馆长高层论坛。中国博物馆学会于9月25日在南通市行政中心举行了年会暨学术研讨会。来自国内外的文博、文化界人士及国际相关机构的代表300余人出席了盛会。